目前猪粪的处理方法有很多，大致包括生物发酵处理、低等动物处理、用作饲料、直接返田处理、用猪粪开发生物有机肥料，还有生态工程学模式。其中生态工程学模式是比较有前景的，并且符合*的可持续发展观。

生态工程学模式是利用生物学及生态学方法综合治理环境污染。目的是尽可能地利用养分和能源，减少或消除环境污染物的排放。其处理方法一般均为多种方法组合。显著优点是能够达到除臭、灭菌、保肥等多种效果。具有较高的经济效益和生态效益，值得在生产中推广应用。干粪堆积发酵作有机基肥;猪粪尿和冲洗水进入化粪池，沉淀打捞。干湿分离后，水份进入水库，水库养鱼;固体物可以用作绿色有机肥。